[問卦] 基因定序的原理？

s820912gmail 09/08 14:44文組！

tom77588 09/08 14:45問基因庫很豐富的台女啊

greensaru 09/08 14:45小精靈忙不過來

veryGY 09/08 14:45我記得是用放大鏡慢慢數 不然你問樓下

Goog1e 09/08 14:45生物課萃取DNA??????

umin928 09/08 14:46你這不是甚麼組 是腦子的問題

tdjpl 09/08 14:46你是萃取DHA吧

sss870192 09/08 14:47不是數ADSL嗎

itoarika 09/08 14:47XD

Neisseria 09/08 14:48用定序儀跑的。要跑一至兩週

alwang 09/08 14:48很簡單吧 1bit=8byte

rintoo 09/08 14:48要用電子顯微鏡才能看到ATCG四個字母

fenrisfang 09/08 14:48文組的腦子用顯微鏡都觀察不到

khalid 09/08 14:494%:都假的啦 只有雞絲修幹是真的

jeff12302000 09/08 14:49很簡單啊，問黨的意思

jimmykuo123 09/08 14:49定序要靠小精靈去看去回報比較慢>.^

SRadiant 09/08 14:49跑1、2週是20年前的事吧...

tonyian 09/08 14:50你帶你兒子去做親子鑑定就知道原理了

rintoo 09/08 14:50DNA很長，看到ATCG字母後移動抄寫序列費

rintoo 09/08 14:50時

vaya 09/08 14:51推 要用電顯。 選我正姐

meowyih 09/08 14:51最討厭的老闆就是只要自己不會做的，都認

owlonoak 09/08 14:5120年前還沒有完全定序這種技術

meowyih 09/08 14:51為很簡單應該不難然後丟給你的那種 XD

SRadiant 09/08 14:52明明就是叫DNA排好報數，照順序報什麼就

owlonoak 09/08 14:52只能看到一部分DNA序列的特徵

Neisseria 09/08 14:52所以現在定序要多久？一至三天？

LukaDoncic 09/08 14:52要先RT 再PCR 再送NGS 再用程式分析se

SRadiant 09/08 14:52記什麼，因為有3萬個左右所以要花一些

SRadiant 09/08 14:52時間

LukaDoncic 09/08 14:52quence 可能還要重複幾次

poi96300 09/08 14:52滴血認親沒看過嗎??????????

scps990607 09/08 14:53搜尋「次世代定序NGS」了解一下

vaya 09/08 14:53而且怕ATCG排列看錯 所以蠻傷眼 所以時間才

vaya 09/08 14:53會那麼長 給你參考

kavengany 09/08 14:53DNA電泳慢慢跑

gn01657736 09/08 14:53DNA才問世30年，技術還不成熟一堆文

gn01657736 09/08 14:53組，ATGC就一堆人就看不懂了

SRadiant 09/08 14:54病毒幾萬個鹼基完整定序沒問題啊

owlonoak 09/08 14:54其實上面有一個鄉民還真的說對了

owlonoak 09/08 14:54真的是叫DNA排好報數

owlonoak 09/08 14:55是長度從一個鹼基到最後一個鹼基這樣

owlonoak 09/08 14:55檢查這一堆長度不等的DNA的最末端鹼基

owlonoak 09/08 14:56這就是目前定序的原理

SRadiant 09/08 14:56NGS出來也快20年囉，2003年就有發表一

SRadiant 09/08 14:57個腺病毒全基因組

duckie 09/08 14:57Sanger定序法 應該不會用到NGS

duckie 09/08 14:57NGS太貴了

SRadiant 09/08 14:57時間過很快的，我剛剛還想了一下畢業幾

s9234032 09/08 14:57游泳>^<

SRadiant 09/08 14:57年了，唸書時那些技術出來幾年了

pastoris 09/08 14:58採後萃取蛋白質體，用delta序列當引子作

pastoris 09/08 14:58PCR，結果sequence分析

v21638245 09/08 14:58反串？

SRadiant 09/08 14:58病毒基因體很小，不貴，而且公家的錢

william10319 09/08 14:591953就發現DNA雙股螺旋結構了啦

SRadiant 09/08 14:59不會用Delta序列當primer喔，那樣看不出

SRadiant 09/08 14:59什麼

william10319 09/08 14:59不懂別裝懂

Mei5566 09/08 14:59用大聲公問它是不是中共同路人

pastoris 09/08 15:03那會用什麼作primer夾出來？

SRadiant 09/08 15:03https://i.imgur.com/oKP7BNV.jpg

SRadiant 09/08 15:04台灣不知不覺也上傳一堆序列了，剛剛還

SRadiant 09/08 15:04看到有人說定序會不會造假...

SRadiant 09/08 15:04https://i.imgur.com/7SnEEYq.jpg

SRadiant 09/08 15:05有些資訊比較齊全的，會有定序技術，像

SRadiant 09/08 15:05這個是用Illumina Iseq

SRadiant 09/08 15:07Illumina iseq 100的話就是NGS

s0920151048 09/08 15:09看顏色，跟紅綠燈一樣

billionaire 09/08 15:09跑膠

SRadiant 09/08 15:10NTU(台大)寫NGS，TSGH(三總)是Illumina

SRadiant 09/08 15:10 NovaSeq

SRadiant 09/08 15:11CGMH(長庚)也是Illumina NovaSeq

egogeorge 09/08 15:11顯微鏡看基因？腦袋有洞

pastoris 09/08 15:1315年過去，現在技術縮寫已經看冇阿

SRadiant 09/08 15:18忘了回，用哪個primer不知道，但會是"通

SRadiant 09/08 15:18用型"(保守區)的，因為你用delta的序列

SRadiant 09/08 15:18來P，沒P出來你只能知道"可能"不是delta

Yahweh 09/08 15:18說用電顯用顯微鏡的先去讀個書好嗎

SRadiant 09/08 15:19，其他啥都不知道

quartics 09/08 15:204%到底有多少無腦文組

basterds 09/08 15:21工作人員半路被hooker攬走

eldar 09/08 15:23好奇學術界、業界一般基因定序要多久時間

freesamael 09/08 15:25XD

kipi91718 09/08 15:26只要不合4%的意就假定序啦 原理不用管

Lynn1122 09/08 15:28推SR大

jeff830621 09/08 15:28文組去了解一下次世代定序吧

pastoris 09/08 15:30了解，那我的認知作法目前還是可行，我

pastoris 09/08 15:30表達不夠完整；不會以突變端序列直接當p

pastoris 09/08 15:30rimer，通常是設計突變處的前後端。

Yahweh 09/08 15:3020年前human genome project 就號稱完成了

Irenicus 09/08 15:30跟文組解釋這個是浪費時間

storyk49240 09/08 15:30這一串滿屌ㄉ

Yahweh 09/08 15:30virus genome 真的小 case

SRadiant 09/08 15:30NGS快也要2、3天吧，不趕通常會是一週

SRadiant 09/08 15:31左右出報告

rfa0323 09/08 15:32現在定序一天左右…

mbpl 09/08 15:33版上那麼多專家，台灣生技有希望。。。還是

mbpl 09/08 15:33相反?

SRadiant 09/08 15:33採檢、檢體傳送就可以過第一天了，除非

SRadiant 09/08 15:33急件或24小時輪班

pastoris 09/08 15:3415年前趕論文數據時急件3天就能知道結果

pastoris 09/08 15:34了，我認為現在新的儀器可以更快

SRadiant 09/08 15:35簡單的數kb基因定序，我還在唸書時就可

SRadiant 09/08 15:35以隔天看結果了

SRadiant 09/08 15:39儀器很快啦，30kb也很小

birdy590 09/08 15:43要先培養病毒吧 量太少還不一定養的出來

jhjhs33504 09/08 15:46前處理有些細節吧 之後就中央極限定理

jonsauwi 09/08 15:55文組要先從PCR開始瞭解起，才能進到Sang

jonsauwi 09/08 15:55er定序，最後才能瞭解NGS吧……

jonsauwi 09/08 15:57做生物的人也多麼希望顯微鏡就能直接定

jonsauwi 09/08 15:57序DNA啊……

Yahweh 09/08 15:59十幾年前有人想要用atomic force microsco

Yahweh 09/08 16:00py + molecular clamp 去"掃"基因序列啦

Yahweh 09/08 16:00現在不知道做到甚麼程度了

abccat0520 09/08 16:05用顯微鏡看DNA好像有點幽默xDDDDDD

nzj 09/08 16:30偷偷告訴你，DNA（也就是俗稱的DHA）是雙股

nzj 09/08 16:31螺旋且互補（只要有其中一條就可以人工做出另

nzj 09/08 16:31一條），且他有4種鹼基（ATGC），可以想成有4

nzj 09/08 16:31種字母的積木。正常的積木可以跟上一個及下一

nzj 09/08 16:31個積木串在一起，而不正常的積木只能跟上一

nzj 09/08 16:31個積木串在一起，而不能跟下一個積木串一起，

nzj 09/08 16:31而這不正常積木會塗上顏色（A的話塗紅色）。

nzj 09/08 16:31接下來把積木串起來，串也不是亂串，而是要

nzj 09/08 16:32看定序的DNA是什麼序列，然後把互補積木串起

nzj 09/08 16:32來，當在串的時後若 隨機拿到塗紅色的積木就

nzj 09/08 16:32不能往下串，這樣重複幾次後就會有不同長度

nzj 09/08 16:32的積木（最後一個積木可能是紅色）。接著用一

nzj 09/08 16:32樣的方法分別把TGC（假設不正常積木分別是藍

nzj 09/08 16:32黃綠）組的積木串完，這樣就有4種不同顏色的

nzj 09/08 16:33積木。接下來，把串起來的積木分別放在跑道，

nzj 09/08 16:33然後越短的跑越快，在終點會有人算名次且只計

nzj 09/08 16:33算有顏色的積木，假設第一名是A（紅），第二

nzj 09/08 16:33名是C（綠），依序是TGAATTCCCC……，這樣子

nzj 09/08 16:34就可以推出序列了

nzj 09/08 16:36（實際在做的時後，有顏色的積木就是接螢光

nzj 09/08 16:36團的鹼基，而螢光團可用螢光偵測器測量）

driftingjong 09/08 17:45這釣得也太沒水準

driftingjong 09/08 17:45自己買一台NGS來做不會啊

e41232003 09/08 22:31用放大鏡紀錄DNA鹼基們排隊報數啊

Zing119 12/25 10:20我司illumina定下去就對了